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時空組學

高通量測序技術助力
時空組學的研究與應用

Applications

隨著生命科學研究的日益深入,傳統(tǒng)的單細胞測序技術已難以滿足對深層次、多維度生命系統(tǒng)探索的需求。時空組學技術應運而生,成為細胞研究領域的新星,它融合時間與空間維度,精準捕捉細胞基因表達及其在組織中的動態(tài)交互,革新了我們對生命奧秘的理解。

華大作為生命科學前沿技術的主要推動者,在2020年年初發(fā)布了自主研發(fā)的時空組學技術Stereo-seq(Spatial Enhanced Resolution Omics-Sequencing),該技術憑借高分辨、大視場、多組學、全物種的優(yōu)勢,已成功應用于胚胎發(fā)育、疾病病理、腫瘤學、腦科學、植物科學等領域,助力科研人員在Cell、Science、Nature等國際頂級期刊上發(fā)表了多項科研成果。

時空組學

時空組學產(chǎn)品方案

產(chǎn)品方案對比

時空轉錄組FF產(chǎn)品方案(V1.3)

時空轉錄組FF V1.3 兼容mIF產(chǎn)品方案

時空轉錄組FFPE V1.1產(chǎn)品方案

時空轉錄組大尺寸芯片產(chǎn)品方案

時空蛋白轉錄組Stereo-CITE產(chǎn)品方案 V1.1

產(chǎn)品方案對比

類別時空轉錄組時空多組學
產(chǎn)品方案時空轉錄FF時空轉錄組FFPE時空轉錄組大尺寸芯片時空蛋白轉錄組Stereo-CITE
捕獲原理樣本類型Poly-A 捕獲隨機探針捕獲Poly-A 捕獲Poly-A 捕獲
檢測組學信息RNARNARNARNA+蛋白

檢測樣本類型

Fresh FrozenFFPEFresh FrozenFresh Frozen

兼容染色方案

SSDNA染色、

H&E染色、

mIF染色(適用于1cm x 1cm)

ssDNA染色、

H&E染色

ssDNA染色、

H&E染色

DAPI染色
捕獲面積

0.5 cm x 0.5 cm、

1 cm x 1 cm

1 cm x 1 cm

1 cm x 2 cm、

2 cm x 2cm、

2 cm x 3 cm可定制尺寸,最大到13 cm x 13 cm

1 cm x 1 cm
檢測物種類型不限物種不限物種不限物種人、小鼠
擴展應用

轉錄組兼容組織形態(tài)學;

轉錄組兼容低通量蛋自檢測;

空間單細胞分析

轉錄組兼容組織形態(tài)學;

微生物共檢測;

非編碼RNA共捕獲;

空間單細胞分析

定制化尺寸、

空間單細胞分析

轉錄組兼容高通量蛋白檢測
分析軟件版本SAW v8.1、StereoMap v4.1SAW v8.1、StereoMap v4.1SAW v8.1、StereoMap v4.1

SAW v8.1、StereoMap v4.1

Stereo-seq時空組學技術

時空組學技術Stereo-seq(SpaTial Enhanced REsolution Omics-sequencing),基于DNA納米球(DNA Nano Ball,DNB)開發(fā),是具有高通量、超高分辨率、大視場的原位全景式技術,可以實現(xiàn)同一樣本在組織、細胞、亞細胞、分子“四尺度”同時進行空間轉錄組分析。該技術通過時空芯片捕獲組織中的 mRNA,并通過時空條形碼(Coordinate ID,CID)還原回空間位置,實現(xiàn)組織中基因空間表達檢測,為深入地了解細胞的基因表達及形態(tài)與局部環(huán)境之間的關系建立強大的研究基礎。

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