據(jù)新華社報道，在第37個世界艾滋病日前夕，中共中央政治局委員、國務院副總理劉國中到中國疾控中心調(diào)研艾滋病防治工作，看望慰問一線防治工作者和相關(guān)科研人員。他強調(diào)，要深入學習貫徹習近平總書記重要指示精神，落實黨中央、國務院決策部署，創(chuàng)新醫(yī)防協(xié)同、醫(yī)防融合機制，壓實各方責任，健全服務體系，扎實做好艾滋病防治各項工作，持續(xù)提升防治成效，為增進人民群眾健康福祉提供有力保障。
不久之前，中國疾病預防控制中心性病艾滋病預防控制中心（以下簡稱“中國疾控艾防中心”）病毒免疫室使用華大智造MGISEQ-2000高通量測序儀和華大序風CycloneSEQ-WT02納米孔測序儀，對HIV病毒近全長擴增子進行了測序分析，鑒定出新的HIV-1CRF分枝CRF172 0755，并提供了該重組型的詳細信息。這對于制定有效的艾滋病防控策略至關(guān)重要，并為理解HIV-1在中國MSM（男男性行為）群體中的傳播和進化提供了新的洞察。值得一提的是，通過將CycloneSEQ納米孔測序儀與DNBSEQ高通量測序儀結(jié)合使用，研究團隊組裝了完整的HIV近全長基因組，為鑒定HIV超感染或新型重組病毒提供了可靠的方法學支撐。
HIV-1CRF分枝CRF172 0755近全長基因組
HIV超感染是指HIV感染者再次感染了一種新的、在系統(tǒng)發(fā)生學上與可檢測到的病毒毒株不同的病毒毒株, 兩種不同的HIV毒株可以進入同一細胞，通過交換基因片段形成新的重組病毒。這種情況可能與初次感染一樣常見，并且不限于高風險人群。多重感染即使在之前已經(jīng)控制了HIV感染的人群中也會發(fā)生，它可能會降低治療的臨床療效，加快病情發(fā)展，并增加HIV抗藥性。通過檢測超感染患者體內(nèi)HIV毒株的基因序列，可以了解HIV毒株的來源重組情況、傳播路線等，這對理解HIV的傳播模式、毒株的變異和進化具有重要意義，也為艾滋病耐藥監(jiān)測和感染溯源提供支撐。
HIV超感染傳播模式示意圖
基因測序技術(shù)能夠提供大量的核酸序列信息，可以覆蓋HIV基因組的近全長，能更準確地識別和區(qū)分HIV的不同亞型和準種以及多種藥物的耐藥位點。相比于傳統(tǒng)的PCR產(chǎn)物克隆法和終點有限稀釋PCR法，基因測序技術(shù)操作更為簡便、檢測成本較低。不僅如此，基因測序技術(shù)還具有高靈敏度，能夠檢測到低豐度的病毒變異，對于監(jiān)測病毒的變異和演化具有重要價值，有助于病毒的溯源調(diào)查、耐藥監(jiān)測以及輔助臨床診斷和治療。
HIV超感染的鑒定之外，HIV-1耐藥監(jiān)測也是全球艾滋病防控的重要組成部分，隨著抗病毒治療的廣泛實施，HIV耐藥性問題逐漸成為影響治療效果的關(guān)鍵挑戰(zhàn)?；驕y序設(shè)備的應用能夠使耐藥突變檢測更加高效精準，為艾滋病抗病毒治療提供有力支持；同時，結(jié)合自動化建庫設(shè)備的使用，可實現(xiàn)樣本處理全流程自動化，大幅減少人工操作時間，提升一致性和效率，為耐藥檢測在各級疾控中心的日常應用和臨床普及奠定基礎(chǔ)。
去年，華大智造基于自主研發(fā)的文庫制備試劑、自動化樣本制備系統(tǒng)、DNBSEQ測序儀以及分析軟件發(fā)布了HIV-1耐藥測序組合產(chǎn)品，實現(xiàn)從病毒RNA到報告全流程覆蓋，可對樣本中的HIV-1病毒進行快速、精準的耐藥檢測和分型，賦能艾滋病耐藥監(jiān)測與流行病學研究。截至目前，該組合相關(guān)設(shè)備已陸續(xù)被引入國家疾控及廣東、廣西、四川、貴州、上海等多個地方疾控中心。
HIV-1耐藥測序組合產(chǎn)品全流程
同時，華大智造已展開研發(fā)基于CycloneSEQ平臺的HIV全長基因組測序組合產(chǎn)品，將充分結(jié)合納米孔基因測序儀長讀長的優(yōu)勢，實現(xiàn)更準確地識別不同亞型和準種，更深入地理解HIV的遺傳多樣性和病毒變異，為識別HIV超感型別提供更靈敏、更準確、更全面的工具支撐。
華大智造是全球少數(shù)幾家能夠自主研發(fā)并量產(chǎn)從Gb級至Tb級低中高不同通量的臨床級基因測序儀企業(yè)之一, 也是全世界唯一擁有激發(fā)光、自發(fā)光、不發(fā)光三種不同技術(shù)路徑測序儀的公司。在公共衛(wèi)生領(lǐng)域，華大智造已形成病原微生物宏基因組測序、靶向測序、全基因組測序等應用場景的全流程產(chǎn)品組合，通過研發(fā)創(chuàng)新持續(xù)為公共衛(wèi)生事件的監(jiān)測和預警提供更自動、更便捷、更高效的自主核心工具。
未來，華大智造將繼續(xù)發(fā)揮工具的創(chuàng)新力量，在改善人類健康之路上與全球生態(tài)伙伴緊密合作，提供覆蓋長短讀長的完整測序解決方案，持續(xù)推動基因測序速度、讀長、準確率及測序成本等各個關(guān)鍵指標突破，讓基因測序更可及、讓生命皆可測，讓科技創(chuàng)新實實在在服務于人類的健康和福祉。
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